Teise taseme bioloogiline ohutuskapp on sama mis bioloogiline ohutuskapp. Gaas voolab ka väljastpoolt teise bioloogilise ohutuskappi, mida tavaliselt nimetatakse sissevooluks. Inflow takistab mikrobioloogiliste toimingute käigus tekkinud aerosoolide esilekutsumist kabineti esiosa aknast laborisse. Kuid need erinevad primaarsetest bioohutuse kabiinidest, kuna ainult HEPA filtreeritud (steriilsel) õhul on lubatud tööpinnale voolata. Sisseehitatud ventilaator tõmbab õhu läbi esiosa avasse korpusesse ja esiklaasi. Seetõttu ei lase filtri poolt filtreerimata õhk tööalasse otse siseneda, kaitstes seega ohutuskapis olevate proovide ja instrumentide välisõhku saastumist.
Sekundaarse bioloogilise ohutuskaamera unikaalne omadus on see, et filtrit filtreeritakse vertikaalse kihilise (mittesuunalise) HEPA filtriga ja korpuse sees moodustatakse õhu allavool. Pidev õhuvool võib tekitada korpuses sisemisi õhk-nakkusi, kaitstes seeläbi infektsioonis olevaid proove. Sellist õhuvoolu nimetatakse pinnaseks.
Peamine erinevus sekundaarsete bioloogiliste ohutusabinõude tüüpide vahel on see, et heitgaasi osakaal ja rõhu all, mis retsirkuleeritakse õhu käes kõrge rõhu all, on erinevad. Lisaks on teistsugustel bioloogilistel ohutuskappidel teistsugused heitgaaside meetodid: mõned ohutuskapid filtreerivad õhku otse ruumi ja mõned väljuvad läbi spetsiaalse ventilatsioonikanaliga ühendatud korpuse või hoone väljalaskesüsteemi. Väljaspool hoone.
Lisaks eespool mainitud erinevustele võivad kõik sekundaarsed bioloogilised ohutuskapid, nagu 1. taseme bioloogilised ohutusabinõud, kaitsta ettevõtjaid ja laborikeskkondi kahjustuste eest. Lisaks kaitseb sekundaarne turvakapp ka tooteproove saastumisest mikroobsete toimingute ajal. Sekundaarset bioloogilist ohutuskappi saab kasutada bioloogiliste tegurite puhul ühe-, kahe- või kolmel tasandil bioloogilisel ohutusel.